我院拟对下列项目组织院级磋商 ，欢迎具有合格资质的供应商参与，具体要求及说明如下。
一．项目内容：
项目编号及名称：2022YH67创新港台式高通量测序仪用耗材及试剂
项目基本概况：MEDX研究院-数字医学研究所购置的高端台式高通量测序仪用相关试剂及耗材（见目录）
二、资格要求：(以下内容资料发送至报名邮箱)
①供应商有效的营业执照（复印件盖公章）
②供应商法定代表人（或其他组织等负责人）对本项目授权书（复印件盖公章）
③制造厂商产品授权书（符合2票制），授权时间为3年（授权以公告后至开标月份为起始时间或年度授权）（复印件盖公章、原件限代理商投标时提供）
④填写报名磋商信息表（Word/Excel可复制版见附表 ）
三、报名时间及获取文件：
2022年11月26日至2022年11月30日（3个工作日）
报名截止后磋商文件发送至供应商提供的电子邮箱.
四、磋商时间：
2022年12月15日上午9点（响应文件递交截止时间），（请及时关注报名预留邮箱，并保持电话通畅）
五、磋商地点：西安市小寨西路196号(西安交通大学第一附属医院行政院区招采办会议室）
六． 联系科室及电话：
1．联系科室：招标采供第4办公室
2．联系人：徐老师
3．联系电话：029--85323684
4．报名邮箱：593605009@qq.com
5.联系地址：西安市小寨西路196号
招标采供办公室
2022年11月25日
附表：报名信息一览表格式
序号 |
标段 |
采购产品名称 |
注册证名称及注册证号 |
供应商名称 |
制造商名称 |
联系人 |
联系电话 |
QQ邮箱 |
1 |
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|
|
|
|
|
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|
2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
1.开放试剂
序号 |
用途 |
品名 |
规格 |
单位 |
备注 |
1 |
清洗试剂 |
Tween-20 |
|
瓶 |
|
2 |
核酸提取试剂 |
DNA提取试剂盒 |
根据不同样本类型选用不同提取试剂盒 |
盒 |
|
3 |
核酸提取试剂 |
RNA病毒提取试剂盒 |
RNA病毒提取 |
盒 |
|
4 |
核酸提取试剂 |
Quick-DNA/RNA Viral Kit |
DNA/RNA病毒提取试剂盒 |
盒 |
|
5 |
核酸提取试剂 |
细菌性呼吸系统感染检测前处理试剂盒 |
前处理及提取试剂盒 |
盒 |
|
6 |
核酸提取试剂 |
DNeasy® Blood&Tissue Kit |
50rxn |
盒 |
|
7 |
文库构建辅助试剂 |
AVENIO Edge HyperPlus with UMI |
一份试剂可匹配24人份样本 |
盒 |
|
8 |
文库构建辅助试剂 |
Agilent High Sensitivity DNA Kit |
|
盒 |
|
9 |
文库构建辅助试剂 |
Agilent DNA 1000 Kit |
|
盒 |
|
10 |
文库构建辅助试剂 |
D1000 ScreenTape |
112rxn |
盒 |
|
11 |
文库构建辅助试剂 |
D1000 Reagents |
112rxn |
盒 |
|
12 |
文库构建辅助试剂 |
100% xylene, ACS grade or higher quality(二甲苯) |
核酸提取FFPE样本前处理 |
瓶 |
|
13 |
文库构建辅助试剂 |
Qubit 1X dsDNA HS Assay Kit |
|
瓶 |
|
14 |
文库构建辅助试剂 |
AMPure XP磁珠 |
|
瓶 |
|
15 |
文库构建辅助试剂 |
AR无水乙醇 |
|
瓶 |
|
16 |
文库构建辅助试剂 |
Nuclease-Free Water (not DEPC-Treated) |
|
瓶 |
|
17 |
文库构建辅助试剂 |
NEB Blunt/TA Ligase Master Mix |
采用标准连接法SQK-LSK110进行EXP-NBD单反应多个文库构建的辅助试剂 |
管 |
|
18 |
文库构建辅助试剂 |
NEBNext FFPE Repair Mix |
采用标准连接法SQK-LSK110进行文库构建的辅助试剂 |
管 |
|
19 |
文库构建辅助试剂 |
NEBNext End repair / dA-tailing Module |
采用标准连接法SQK-LSK110进行文库构建的辅助试剂 |
管 |
|
20 |
文库构建辅助试剂 |
1 M TrisHCl, pH 8.0 |
|
瓶 |
|
21 |
文库构建辅助试剂 |
1M Tris-HCl pH7.0 |
|
瓶 |
|
22 |
文库构建辅助试剂 |
氢氧化钠溶液 BioUltra, for molecular biology, 10 M in H2O |
|
|
|
23 |
文库构建辅助试剂 |
NEBNext Quick Ligation Module |
采用标准连接法SQK-LSK110进行文库构建的辅助试剂 |
管 |
|
24 |
文库构建辅助试剂 |
Qubit dsDNA HS kit |
核酸定量 |
盒 |
|
25 |
文库构建辅助试剂 |
VAHTS Library Quantification Kit for Illumina |
文库定量qPCR试剂 |
盒 |
|
26 |
文库构建试剂 |
LunaScript® SuperMix反转录试剂盒 |
RNA逆转录 |
盒 |
|
27 |
文库构建试剂 |
Q5®热启动超保真2X预混液 |
扩增试剂 |
盒 |
|
28 |
文库构建试剂 |
SARS-COV-2引物 |
新冠病毒引物池，专门用于新冠溯源 |
盒 |
|
29 |
文库构建试剂 |
呼吸2.0试剂盒（呼吸2.0接头） |
文库构建试剂 |
盒 |
|
30 |
文库构建试剂 |
呼吸3.0扩增试剂盒 |
文库构建试剂 |
盒 |
|
31 |
文库构建试剂 |
AVENIO ctDNA Surveillance Kit |
适用于ctDNA的建库试剂盒 |
盒 |
|
32 |
文库构建试剂 |
AVENIO ctDNA Expanded Kit |
适用于ctDNA的建库试剂盒 |
盒 |
|
33 |
文库构建试剂 |
AVENIO FFPET Surveillance Kit（FFPE MRD） |
适用于FFPE的建库试剂盒 |
盒 |
|
34 |
文库构建试剂 |
AVENIO FFPET Expanded Kit（FFPE大PANEL） |
适用于FFPE的建库试剂盒 |
盒 |
|
35 |
文库构建试剂 |
truChIP® Chromatin Shearing Kit with Formaldehyde |
DNA剪切仪配套试剂 |
盒 |
|
36 |
文库构建试剂 |
truChIP® FFPE Chromatin Shearing Kit |
DNA剪切仪配套试剂 |
盒 |
|
37 |
文库构建耗材 |
Qubit Assay Tubes |
Qubie配套耗材 |
包 |
|
38 |
文库构建耗材 |
8micro TUBE Strip（12） |
DNA剪切仪配套耗材 |
盒 |
|
39 |
文库构建耗材 |
microTUBE-130 AFA Fiber Screw-Cap |
DNA剪切仪配套耗材 |
盒 |
|
40 |
文库构建耗材 |
0.2 ml薄壁PCR离心管 |
|
盒 |
|
41 |
文库构建耗材 |
1.5 ml/2ml Eppendorf DNA LoBind离心管 |
|
包 |
|
42 |
文库构建耗材 |
1000μL、200μL、100μL、20μL、10μL带滤芯枪头 |
|
盒 |
|
封闭试剂
序号 |
用途 |
品名 |
规格型号 |
规格 |
单位 |
|
备注 |
1 |
测序辅助试剂 |
PhiX Control v3 |
|
上机内参 |
|
illumina |
|
2 |
文库构建试剂 |
TruSight Oncology 500 DNA High-Throughput (48 Samples) |
|
48人份 |
盒 |
illumina |
|
3 |
文库构建试剂 |
IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples) |
|
96人份 |
盒 |
illumina |
|
4 |
建库 |
Illumina® DNA Prep with Exome 2.0 Plus Enrichment, (S) Tagmentation Set B (96个样本, 12-plex) |
20077595 |
96 |
盒 |
illumina |
|
5 |
建库 |
Illumina® DNA Prep with Exome 2.0 Plus Enrichment, (S) Tagmentation Set D (96个样本, 12-plex) |
20077596 |
96 |
盒 |
illumina |
|
6 |
核酸提取 |
Flex Lysis Reagent Kit (96次反应) |
20018706 |
96 |
盒 |
illumina |
|
7 |
特异性接头 |
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A,酶切法片段化（96个标签，96个样本） |
20027213 |
96 |
盒 |
illumina |
|
8 |
特异性接头 |
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C,酶切法片段化（96个标签，96个样本） |
20042666 |
96 |
盒 |
illumina |
|
9 |
建库 |
Illumina® DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (96 Samples) |
20041795 |
96 |
盒 |
illumina |
|
10 |
特异性接头 |
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples) |
20027213 |
96 |
盒 |
illumina |
|
11 |
核酸提取 |
Flex Lysis Reagent Kit (96次反应) |
20018706 |
96 |
盒 |
illumina |
|
12 |
建库 |
TruSight Oncology 500 DNA/RNA High-Throughput（大样本量方案）试剂盒（24样本） |
20040764 |
24 |
盒 |
illumina |
|
13 |
建库 |
TruSight Oncology 500 DNA/RNA High-Throughput（大样本量方案）试剂盒（72样本） |
20040766 |
72 |
盒 |
illumina |
|
14 |
特异性接头 |
IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set A，Ligation（96标签，96样本） |
20034701 |
96 |
盒 |
illumina |
|
15 |
特异性接头 |
IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set B，Ligation（96标签，96样本） |
20034702 |
96 |
盒 |
illumina |
|
16 |
测序芯片 |
NovaSeq 6000 SP Reagent Kit v1.5 |
|
具体数据量详见‘3.测序kit参数’ |
盒 |
illumina |
|
17 |
测序芯片 |
NovaSeq 6000 S1 Reagent Kit v1.5 |
|
具体数据量详见‘3.测序kit参数’ |
盒 |
illumina |
|
18 |
测序芯片 |
NovaSeq 6000 S2 Reagent Kit v1.5 |
|
具体数据量详见‘3.测序kit参数’ |
盒 |
illumina |
|
19 |
测序芯片 |
NovaSeq 6000 S4 Reagent Kit v1.5 |
|
具体数据量详见‘3.测序kit参数’ |
盒 |
illumina |
|
20 |
清洗试剂 |
清洗试剂盒 |
EXP-WSH004 |
芯片清洗试剂盒，每个试剂盒可清洗6次测序芯片，每个试剂盒可匹配144人份新冠溯源样本 |
盒 |
Oxford Nanopore Technologies(牛津纳米孔科技有限公司) |
|
21 |
测序辅助试剂 |
测序启动扩展试剂盒-Nanopore |
EXP-FLP002 |
上机缓冲液，每一盒测序试剂盒送一盒 |
盒 |
Oxford Nanopore Technologies(牛津纳米孔科技有限公司) |
|
22 |
测序芯片 |
Flow Cell(测序芯片) |
FLO-MIN106D |
测序芯片Flow cells R9.4。一张芯片可产生30Gb数据，每张芯片可测24人份新冠溯源样本 |
张 |
Oxford Nanopore Technologies(牛津纳米孔科技有限公司) |
|
23 |
文库构建试剂 |
Native Barcoding Kit 1-12(无扩增条形码扩展试剂盒1 -12) |
EXP-NBD104 |
EXP-NBD104,用于混样测序，一共12个条码，可配合构建6个标准DNA文库。每个试剂盒可匹配144人份新冠溯源样本 |
盒 |
Oxford Nanopore Technologies(牛津纳米孔科技有限公司) |
|
24 |
文库构建试剂 |
快速条码测序试剂盒 |
SQK-RBK004 |
快速法文库构建试剂，一个试剂盒包含6次反应（每次反应最多12个样本），可构建72个快速DNA文库。 |
盒 |
Oxford Nanopore Technologies(牛津纳米孔科技有限公司) |
|
25 |
文库构建试剂 |
SQK-PBK004 |
SQK-PBK004 |
快速PCR法文库构建试剂，一个试剂盒包含6次反应（每次反应最多12个样本），可构建72个快速PCR文库。 |
盒 |
Oxford Nanopore Technologies(牛津纳米孔科技有限公司) |
|
26 |
文库构建试剂 |
Ligation Sequencing Kit 1D (PM)(连接测序试剂盒) |
SQK-LSK110 |
SQK-LSK110，一个试剂盒包含6个反应，可构建6个标准DNA文库。每个试剂盒可匹配144人份新冠溯源样本 |
盒 |
Oxford Nanopore Technologies(牛津纳米孔科技有限公司) |
|
27 |
实验对照 |
Control Expansion(标准控制实验扩展包) |
EXP-CTL001 |
EXP-CTL001，DNA标准品。一个试剂盒含6个标准反应，每个试剂盒可匹配144人份新冠溯源样本 |
盒 |
Oxford Nanopore Technologies(牛津纳米孔科技有限公司) |
|
1.测序kit参数
Flow Cell Type |
SP |
S1 |
S2 |
S4 |
1 × 35bp |
N/A |
N/A |
N/A |
280-350 Gb |
2 × 50bp |
65-80 Gb |
134-167 Gb |
333-417 Gb |
N/A |
2 × 100bp |
134-167 Gb |
266-333 Gb |
667-833 Gb |
1600-2000 Gb |
2 × 150bp |
200-250 Gb |
400-500 Gb |
1000-1250 Gb |
2400-3000 Gb |
2 × 250bp** |
325-400 Gb |
N/A |
N/A |
N/A |
*Specifications based on Illumina PhiX control library at supported cluster densities.
** Maximum read length.
